Одна из старейших лабораторий Института – создана в 1954 г. Лаборатория проводит комплексные исследования биоразнообразия, зоогеографии, биологии, воспроизводства и развития рыб, структуры и процессов формирования ихтиофауны морей России и Мирового океана. Они охватывают моря и океаны всех климатических зон от Арктики до Антарктики.

Розман Борис Яковлевич

Руководитель лаборатории
кандидат технических наук

Лаборатория подводной видеотехники
Морская техника

Рогинский Константин Александрович

Руководитель лаборатории, ведущий научный сотрудник,
кандидат технических наук

Лаборатория техники подводных исследований и испытаний
Морская техника

Сагалевич Анатолий Михайлович

Руководитель лаборатории
доктор технических наук, профессор

Лаборатория научной эксплуатации глубоководных обитаемых аппаратов
Морская техника

Римский-Корсаков Николай Андреевич

Руководитель лаборатории,
доктор технических наук, главный научный сотрудник, профессор

Лаборатория гидролокации дна
Морская техника

Мокиевский Вадим Олегович

Руководитель лаборатории, главный научный сотрудник,
доктор биологических наук

Лаборатория экологии прибрежных донных сообществ
Экология морей и океанов

Маккавеев Петр Николаевич (1955 - 2020)

С 2000  по 2020 г.  руководитель Лаборатории биогидрохимии,
доктор географических наук

Гебрук Андрей Викторович

Исполняющий обязанности заместителя директора по научной работе направления Экология морей и океанов
руководитель лаборатории, доктор биологических наук

Лаборатория донной фауны океана
Экология морей и океанов
Дирекция ИО РАН

Верещака Александр Леонидович

Руководитель лаборатории, главнй научный сотрудник, 
доктор биологических наук,
член-корреспондент РАН, профессор

Лаборатория структуры и динамики планктонных сообществ
Экология морей и океанов