Музейный фонд составляют экспонаты четырех основных подразделений – физического, технического, геологического и биологического. В научно-вспомогательном фонде собраны архивные и фото-материалы, научно-справочная библиотека.

Архивный фонд Музея используется в научных, а также специфически музейных целях и состоит из материалов, в первую очередь, связанных с историей Института океанологии.  Особое место  среди них занимают  документы, фотографии и предметы известных советских исследователей-океанологов.

• Курвиметр Курвиметр
• Фотоальбом Фотоальбом
• Альбом «Индустрия» Альбом «Индустрия»
• Альбом «Индустрия» Альбом «Индустрия»
• Карта Арктики Карта Арктики
• Чучело головы... Чучело головы...
• Пальто меховое Пальто меховое
• Лампа Лампа
• Микроскоп с... Микроскоп с...
• Прибор оптический... Прибор оптический...
• Чучело пингвина Чучело пингвина
• Чучело молодого... Чучело молодого...
• Чучело королевского... Чучело королевского...
• Модель НИС... Модель НИС...
• Модель судна... Модель судна...
• Круг спасательный Круг спасательный
• Анемометр чашечный... Анемометр чашечный...
• Часы настенные... Часы настенные...
• Барометр Барометр
• Мебель из... Мебель из...
• Телефонный аппарат-станция Телефонный аппарат-станция
• Пианино Пианино
• Модель НИС... Модель НИС...
• Модель НИС... Модель НИС...
• Модель парусной... Модель парусной...
• Модель ГОА... Модель ГОА...
• Комбинезон экипажа Комбинезон экипажа
• Стаканчики, изме... Стаканчики, изме...
• Модель ГОА... Модель ГОА...
• Макет работ... Макет работ...
• Модель буксируе... Модель буксируе...
• Модель буксируе... Модель буксируе...
• Якорь у... Якорь у...
• Якорь с... Якорь с...
• Якорь с... Якорь с...
• Макет аппарата... Макет аппарата...
• Страница из... Страница из...
• Latimeria Chalum... Latimeria Chalum...
• Шейный позвонок... Шейный позвонок...
• Ребро кита Ребро кита
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Мокрые препара... Мокрые препара...
• Губки стеклян... Губки стеклян...
• Китовый ус Китовый ус
• Чучело черепа... Чучело черепа...
• Коллекция раковин Коллекция раковин
• Коллекция кораллов Коллекция кораллов
• Раковина тридакны Раковина тридакны
• «Акванавты» «Акванавты»
• Картина А.Б.... Картина А.Б....
• Вулкан «Кар-Кар» Вулкан «Кар-Кар»
• Глобус большой Глобус большой
• Спасательный круг... Спасательный круг...
• Спасательный круг... Спасательный круг...
• Позвонок кита Позвонок кита
• Психрометр аспира... Психрометр аспира...
•